Bireyler ve ırklar arasındaki genetik varyasyon belgelendiğinden, koyunlarda parazit enfeksiyonlarının sürdürülebilir kontrolü için gastrointestinal nematodlara karşı direnci artırılmış hayvanların seçici olarak yetiştirilmesi önerilmiştir. Gerçekten de, koyunlarda gastrointestinal nematod direnci için vekil özelliklerin kalıtsallığına ilişkin tahminler 0,01 ila 0,65 arasında değişmektedir, ancak genellikle orta düzeydedir. Farklı nematod türlerine karşı direnç birbiriyle ilişkili olma eğilimindedir; farklı parazit türlerinden veya cinslerinden kaynaklanan genetik korelasyonlar genellikle 0,50’ye yakın veya bazı durumlarda daha yüksektir.

Süt koyunlarında süt üretim özellikleri ile parazite karşı direnç arasında olumsuz ancak düşük genetik korelasyonlar gözlemlenmiştir. Diğer çalışmalar, koyunlarda dışkı yumurta sayısı (FEC) ile yapağı üretim özellikleri arasında -0,17 ila 0,21 arasında ve FEC ile et üretim özellikleri arasında -0,63 ila 0,24 arasında değişen genetik korelasyonlar bildirmiştir.

Bu nedenle, koyunlarda gastrointestinal nematodlara karşı direnç ıslahı düşünülebilir, ancak genetik değerlendirmeler için gerekli olan yapılandırılmış seçim şemaları ve hem performans hem de pedigri bilgilerinin doğru bir şekilde kaydedilmesi gerekir.

Geleneksel olarak, bir popülasyonun/türün genetik olarak iyileştirilmesi bir seleksiyon programı, örneğin çiftçilerin kolektif bir organizasyonunu gerektirir:

• performans kaydı;
• pedigri kaydı;
• Damızlık hayvanların doğal çiftleşme ve/veya suni tohumlama yoluyla değişimi.

Pedigri ve performans kaydına doğrudan dahil olan çiftçilerin (yetiştiriciler) oranı, seçime sunulan tüm popülasyonun en az %10-20’sini temsil edecek şekilde mümkün olduğunca büyük olmalıdır.

Geri kalan çiftçiler (ticari çiftçiler), yetiştiricilerden gelen tahmini performans bilgisine sahip hayvanları (çoğunlukla erkekler) kullanarak yetiştiriciler tarafından üretilen genetik iyileştirmeden faydalanabilir.

Şekil 1 – Nüfusun piramidal yönetimi (Kaynak: Barillet F., 2001)

Seçim planının maliyet/fayda analizi, bu kuruluşun karlılığını sağlamak için dikkatlice yapılmalıdır, örneğin gelirler uzun vadeli Nüfus düzeyinde maliyetlerden daha yüksek olmalıdır.

Dışkı yumurta sayısı (FEC), yani gram dışkı başına parazit yumurtası sayısı, doğal otlatma koşullarında gastrointestinal nematodlara karşı bireysel direnci ölçmek için büyük ölçüde bir vekil özellik olarak kullanılmıştır.

Bununla birlikte, gastrointestinal nematod direncinin yukarıda açıklandığı gibi geleneksel ıslah programlarına dahil edilmesi, saha koşullarında ölçümünün çok zahmetli ve maliyetli olması nedeniyle FEC’nin büyük ölçekte kaydedilmesinin zorluğu nedeniyle engellenmektedir.

Doğal istila durumunda, yıllık örnekleme sıklığı ve miktarı iklim koşullarına ve ırklara göre değerlendirilmelidir. Her durumda, genetik değerlendirme için yararlı verilere sahip olmak amacıyla, tüm sürünün örneklenip örneklenmeyeceğine karar vermek için seleksiyon programına dahil olan sürüdeki koyunların temsili bir örneği periyodik olarak izlenmelidir, Örneğin Enfekte hayvan sayısı ve enfestasyon seviyesinin bireysel değişkenliği değerlendirmek için yeterli olduğu düşünüldüğünde, bireysel FEC tüm sürü üzerinde ölçülebilir.

Pedigri kaydı geleneksel olarak tek ebeveynli doğal çiftleşme ve/veya suni tohumlama ile gerçekleştirilebilir. Her iki uygulama da zahmetli ve maliyetlidir ve çiftçileri seleksiyon programlarına katılmaktan vazgeçirebilir.

EID, anne/kuzu çiftlerinin erken tanımlanmasına ve soyağacı kaydına olanak tanıyan umut verici bir araçtır. DNA analizine dayalı bir ebeveyn ataması için maliyetlerin gelişimini takip etmek önemlidir, çünkü bu, çoklu efendi çiftleşmesi kullanan sürülerin soyağacı bilgilerini de toplamasına olanak tanıyacaktır.

Mevsimsellik ve otlatma sistemi, istila seviyesini güçlü bir şekilde etkilemektedir.

Enfestasyon seviyesini etkileyen çevresel faktörlerle ilgili daha fazla veri, ıslah değerlerinin tahmin edilmesi için genetik modele dahil edilmek üzere kaydedilmelidir:

• Çiftlik yönetimi ağırlıklı olarak otlatma sistemi.
• Yaş
• Parite
• Kuzulama tarihi
• Örnekleme tarihi
• Antelmintik uygulama sıklığı, tarihi ve molekülü

Kaydedilen tüm veriler, her bir hayvan için tahmini üreme değerleri üretmek için kullanılmalıdır.

Genetik değerlendirme için büyük veri kümelerini ve modern metodolojileri (BLUP) yönetebilecek bilim insanlarının mevcudiyetini planlamak yetiştirici organizasyonu için çok önemlidir.

Yukarıda belirtildiği gibi, ticari sürülerdeki koyunlarda FEC ölçümleri son derece maliyetli ve zahmetlidir. Yapay zorluklara verdikleri yanıt temelinde seçilen koyunların doğal enfeksiyona maruz kaldıklarında benzer şekilde yanıt verdikleri gösterilmiş ve yapay veya doğal enfeksiyon altında kaydedilen FEC arasında yüksek bir pozitif genetik korelasyon olduğu tahmin edilmiştir. Ayrıca, koçların yapay zorluklardan sonra parazit direnci için seçilmesinin, dişi yavrularının doğal koşullarda parazit enfeksiyonlarına karşı direncini artırmaya izin verdiği gösterilmiştir.

Bu nedenle alternatif bir yaklaşım, yapay zeka döl testi veya performans testi için toplanan koçları standart dozlarda larvalarla yapay olarak enfekte ederek seçmek olabilir.

Koyunlarda, gastrointestinal nematodlar için dirençte önemli artışlara neden olan genlerdeki mutasyonlar şimdiye kadar tespit edilmemiştir. Dolayısıyla, DNA’ya özgü nedensel mutasyonlara/LD belirteçlerine dayalı seçilim kısa vadede düşünülemez.

Son on yılda, genomik seleksiyon, bireyler arasındaki gerçekleşen ilişkileri tanımlamak için geleneksel soyağacı matrisi yerine kullanılabilen orta yoğunluklu DNA dizilerinin azalan maliyetleri nedeniyle çiftlik hayvanlarının genetik gelişimi için referans yaklaşım haline gelmiştir.

Bununla birlikte, geleneksel süt sığırcılığı yaklaşımında olduğu gibi, seleksiyon adaylarının genomik ıslah değerleri yalnızca çok sayıda genotiplenmiş hayvan veya bunların dölleri üzerinde onlarca yıldır kaydedilen özellikler için hesaplanabilir.

Böylece, gastrointestinal nematod direnci için genomik seleksiyon uygulamaları, ticari çiftliklerde kullanılacak genç koçların damızlık değerlerini tahmin etmek için referans popülasyon olarak hizmet eden dişi çekirdeklerden yararlanılarak tasarlanabilir Örneğin Çekirdek sürünün genotipleri ve fenotipleri kullanılarak, ticari çiftliklerde yetiştirilen ve genetik olarak deneysel sürü ile bağlantılı olan seçici aday erkeklerin genotiplendirilmesi.